休日出勤が増え代休申請　手当を支給しているはずだが

労働者から休日出勤が増えたので代休がほしいと申請がありました。しかし、当該労働者には休日出勤や残業のための手当も付与し、そこには休日出勤分の給与も含まれていると考えています。疲労回復の観点から代休付与は必要と考えますが、代休を付与するのなら手当の日数分を控除したいです。可能でしょうか。（東京・Нロジスティクス）